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在脑科学研究中,成像数据的体量正以巨大的速度膨胀。从双光子显微镜到光片显微镜,从全脑透明化成像到活体钙成像,一次实验就能产生数十GB甚至TB级的图像数据。然而,数据采集只是第一步,真正的挑战在于如何高效、准确地处理和分析这些海量数据。传统图像处理工具往往通用性强但针对性弱,面对脑科学的三维体数据、神经元追踪、突触定位等需求时,研究者不得不编写大量自定义脚本,既耗时又容易出错。百会新知的Lychnis正是为解决这一痛点而生——一款专门为脑科学成像数据处理而开发的软件平台。为什么...
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1Zheng,W.,Mu,H.,Chen,Z.,Liu,J.,Xia,D.,Cheng,Y.,Jing,Q.,Lau,P.-M.,Tang,J.&Bi,G.-Q.NEATmap:ahigh-efficiencydeeplearningapproachforwholemousebrainneuronalactivitytracemapping.NationalScienceReview(2024)nwae109.2Li,X.H.,Shi,W.,Zhao,Z.X.,Matsuur...
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神经纤维分析在病理切片中主要用于评估有髓纤维数量、轴突直径、髓鞘厚度、纤维密度和再生状态。相比肉眼观察,定量方法能把病理改变转化为可比较的数值指标,常用于周围神经损伤、糖尿病病变、炎症脱髓鞘及再生修复研究。切片制备决定后续定量上限。常规HE染色可看较大神经束轮廓,但对细小纤维显示有限;镀银染色能突出神经纤维形态;甲苯胺蓝半薄切片适合观察有髓纤维和髓鞘结构;免疫组织化学则用PGP9.5、神经丝蛋白、S100、CGRP、TH等标记不同类型神经纤维。标记物选择要看研究目标,泛神经元...
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全脑透明化技术是神经科学研究领域的重要实验手段,通过对脑组织进行脱脂脱色与光学通透处理,消除脑部组织的光散射与光吸收特性,实现完整脑部样本的无切片三维成像。结合三维成像扫描技术,可以完整呈现脑神经环路、细胞分布与组织结构空间信息,为脑部机理研究、病变分析提供直观的数据支撑。深入解析技术原理与处理逻辑,能够规范实验操作,提升成像完整性与精准度。全脑透明化脱脂处理的核心作用是去除组织内部脂质成分。脑组织含有大量脂肪结构与脂质夹层,这类成分折射率不均,会造成光线散射,阻碍深层成像观...
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B‑S‑1018型全自动振动切片机定位在于:生物组织、类器官、植物根茎叶、透明化厚切片通用科研机型,主打全自动、高性价比、稳定耐用。一、切片精度优势Auto‑Zero‑Y自校准振动头,Y轴振动位移<1μm,切片表面平整、厚度均匀,减少撕裂、褶皱,适合脑组织、类器官、组织透明化三维成像、免疫荧光制样厚度15–3000μm连续可调,最小步进1μm;振动频率0–60Hz(1Hz步进),进给速度0.01–10mm/s,参数精细化可控连续全自动切片模式,避免人工手推带来的厚度波动,适合...
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在脑科学与生物医学研究高速发展的当下,组织透明化与三维成像技术已成为解析器官结构、追踪神经环路、验证药物药效的核心工具。成立深圳光明区的深圳百会新知科技有限公司,依托原创顶刊技术快速崛起,成为国内透明化成像服务领域的ling军企业。近日,脑创网专访了百会新知CTO丁露锋,据了解,丁总毕业于中科大,有近十年的脑科学及数据处理经验,其研究成果多次发表在nature、CELL等顶刊。并且丁总团队独立研发出Lychnis数据处理软件,成为脑科学成像数据处理的理想工具。以下是采访实录。...
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Q1:切片透明化和整脑透明化,在透明化效果上有什么核心差别?A:小鼠大脑属于厘米级组织,如果直接做整脑透明化,透明试剂由外向内渗透,会天然形成梯度差异,脑组织深部散射强、折射率不均匀,容易出现深层信号弱、背景浑浊的问题。即便采取改良手段,也很难规避这一物理层面的局限。百会新知的方案是将全脑切成300μm厚片后再开展透明化。脑片厚度仅为全脑的1/30‑1/50,试剂渗透快速且均匀,几乎不存在深部散射问题,透明效果一致性好,成像信噪比高、伪影少,最终的数据质量更稳定。Q2:切片过...
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因为百会新知采用的是切片透明化成像技术,有些人还是担心片间损耗问题,下面就这个问题一次说清楚。一、核心结论不同于其他公司的切片技术,百会新知VISoR成像设备采用的是厚切片技术,相对来说片间损耗极小,对c-Fos细胞计数、脑区分布统计几乎无影响;若采用升级版的Blockface-VISoR整鼠全身成像模式,则无任何片间间隙损耗。二、精准损耗数据•绝对片间切削损耗:<5μm(刀片剔除的细碎组织层)•切片标准厚度:300μm厚切片•损耗占比:<1.7%•神经元细胞核直径:8–12...